Като подправка хвойната се използва за мазни, тежки ястия основно в кухнята на Средна Европа.
У нас се употребява рядко. Суровите и изсушени шишарки се поставят в началото на варенето на ястия от говеждо, овнешко и свинско месо, в ястия от зеле, в маринати и др. Преди поднасяне на блюдото шишарките се отстраняват.
Хвойната се комбинира добре с черен пипер, дафинов лист, целина, лук, магданоз, хрян, горчица.
От шишарките се приготвят ароматизирани ракии и вина.
Като лекарствено средство хвойната играе важна историческа роля – използавна е при епидемиите от чума, холера или тиф.
Етеричното масло от хвойна е употребявано от векове заради антисептичните и диуретичните му свойства.
Хвойната стимулира циркулацията на кръвта и се препоръчва, като пречистващо средство при всички проблеми свързани с кръвта и кожата.
Засилва имунната система.